1、结构不同：一次性三层口罩是由专业用于医疗卫生的纤维无纺布内两层,中间增加一层起过滤防菌达99%的以上过滤溶喷布经超声波焊接而成, 鼻梁处采用环保型全塑条,不含任何金属,配带透汽，舒适。
医用外科口罩一般由非织造布材料制造而成，包括过滤层、口罩带以及鼻夹。标准的医用外科口罩分3层。
2、适用场景不同：一次性口罩可适用于电子制造业、无尘车间,餐饮服务业、食品加工、学校、骑机车、喷涂加工,冲压五金,电镀，化工，钢铁，电焊地，卫生院,手加工业、医院、美容、制药、 工厂、环境清洁、公共场合等多种用途。
医用外科口罩可以阻隔大部分细菌和部分病毒，能防止医务人员被感染，又能防止医务人员向外界传播病原菌，所以适用于临床医务人员的基本防护，即用于临床医务人员在有创操作过程中佩戴，为接受处理的患者及实施有创操作的医务人员提供防护，阻止血液、体液和飞溅物传播。
3、作用不同：医用外科口罩对于细菌、病毒的抵抗能力较强，在日常生活中，可用于预防流感、呼吸系统等传染疾病的传播，还可以避免患者将病毒传染给他人。
一次性口罩能在一定程度上预防呼吸道感染，无法防霾。